ファイルから入力した配列に対してトリミング処理を行い新しいファイルに出力します。トリミングには以下のような処理があります。

• アダプター (パターン指定) 配列切除
• poly-A(T) tail 切除
• クオリティ閾値配列切除
• ベース数指定配列切除

また、条件を指定して配列を取り除く処理も行います。配列除去には以下のような処理があります。

• あいまいなベースを含む配列の除去
• 長さ制限による配列の除去