核酸またはアミノ酸同士の複数の配列データについて、ギャップを考慮した自動アライメントを行い、結果を複数配列編集ウインドウに表示します。アライメント後の配列データは複数配列編集ウインドウで編集することができます。アライメントの結果は複数配列編集ウインドウ上からテキスト、またはグラフィックで表示することができ、系統樹を作成することも可能です。また、複数配列編集ウインドウでは表示する配列を配列コードごとに色分けして表示することも可能です。

核酸・アミノ酸配列の長さ
　　　無制限（メモリに依存）
核酸・アミノ酸配列本数
　　　無制限（メモリに依存）

特長

1. 自動アライメント。
2. 編集途中の状態を保存しておき、後日の作業再開が可能。
3. スコアテーブルの登録、確認、削除。
4. EMBL、GenBank®、CODATA、SWISS-PROT、FASTA、および配列のみのファイルの読み込みが可能。