GENETYX-SV/DB は、大容量データベース (GenBank、EMBL等) をサーバー上に構築し、クライアントから高速にホモロジー検索・キーワード検索を行い、またデータベースを
毎日更新するデイリーアップデート等を行うソフトウェアです。
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機能一覧
- インターネット上の配列データバンク (EMBL、GenBank 等) から最新データを取得しサーバーにデータベース化
- デイリーアップデートデータで最新データベースのサーバーの維持
- データベースに対するキーワード検索、ホモロジー検索機能
- プライベートデータベースソフトウェア
- シーケンサーからの出力等から得られた配列データを独自にクライアントデータベース化
- クライアントのデータベースに登録、更新、削除等の機能
- クライアントのデータベースに対するキーワード検索、複数のキーワードによる絞込み検索
- クライアントのデータベースに対するホモロジー検索機能 FASTA、BLAST
- クライアントのデータベースに対するホモロジー検索のバッチ処理
- 対応データベース
- 核酸データベース EMBL、GenBank
- 蛋白質データ NBRF (PIR)
- 転写因子データベース TFD
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動作環境
| UNIX サーバー | |
| 対応機種 | Sun Ultra シリーズ , SPARC station シリーズ |
| OS | Solaris7 以上 |
| メモリ | 64 MB 以上 |
| HDD容量 | 30 MB 以上（GenBank 全てを構築する場合 50 GB 以上必要） |
| スワップエリア | 1 GB 以上 |
