CpG island 候補検索

Larsen ら、および Gardiner-Garden と Frommer の CpG island の定義に基づき CpG island を予測します。

CpG island とは、ゲノム上に島状に点在する、CpG 配列を多く含む領域です。長さ数百塩基対で、ゲノムの他の領域に比べ 10 倍以上の CpG 配列を持ち、哺乳類ではゲノム上に約 3 万ほど存在します。CpG island の多くがハウスキーピング遺伝子のプロモーター領域に存在するとされています。