エクソン部位検索

エクソン部位検索機能は、ゲノム配列上に存在するエクソン部位を既知の cDNA 配列とのホモロジーを用いて検索する機能です。 ホモロジー検索部分には、高速・高感度な方法として多用されている Lipman-Pearson 法を採用しています。 参照配列となるゲノム配列データ (Genome Sequence) と比較対象配列の cDNA 配列データ (cDNA Sequence) とを高速に比較し、相同性 (ホモロジースコア) の高い配列データ部分について配列の欠落 (GAP) を考慮したアラインメントを行い、入力された条件を満たした部分をエクソンの候補として出力します。