マルチプルアライメント

核酸またはアミノ酸同士の複数の配列データについて、ギャップを考慮した自動アライメントを行い、結果を複数配列編集ウインドウに表示します。アライメント後の配列データは複数配列編集ウインドウで編集することができます。アライメントの結果は複数配列編集ウインドウ上からテキスト、またはグラフィックで表示することができ、系統樹を作成することも可能です。また、複数配列編集ウインドウでは表示する配列を配列コードごとに色分けして表示することも可能です。

核酸・アミノ酸配列の長さ

無制限（メモリに依存）

核酸・アミノ酸配列本数

無制限（メモリに依存）

特長

1. 自動アライメント。
2. 編集途中の状態を保存しておき、後日の作業再開が可能。
3. スコアテーブルの登録、確認、削除。
4. EMBL、Genbank^®、CODATA、SWISS-PROT、FASTA、および配列のみのファイルの読み込みが可能。

グラフィック表示

複数配列編集ウインドウ上のアライメント結果をグラフィックで表示します。

Frame - 一致部分を枠で囲んで表示

Invert - 一致部分を反転表示

Fill - 設定された色で塗りつぶし表示

Mismatch - その列の中で最も出現頻度の高い文字と異なる文字をハイライト表示

Idnt & Sim - 完全一致している列を黒で、一致している列をグレイで表示

Gray - 完全一致している列を黒で、一致している文字をグレイで表示