核酸配列自動結合

核酸配列自動結合ソフトウェア ATGC は、核酸配列の断片から結合部分を自動検索して巨大な核酸配列に結合します。以下に ATGC が搭載するいくつかの解析機能をご紹介します。

全シーケンスの自動結合

ATGC で読み込んだすべてのシーケンスを自動結合してコンティグを作成します。

全コンティグの自動結合

「全シーケンスの自動結合」で作成したすべてのコンティグを結合して、さらに大きなコンティグを作成します。

繋がらなかったシーケンス同士の自動結合

「全シーケンスの自動結合」では結合されなかったシーケンスの中からお互いに繋がるシーケンスがあるかどうかを調べます。

波形ファイルのサポート

ABI フォーマットと SCF フォーマットの波形ファイルを読み込んで表示します。

以上の解析機能を使用して作成したコンティグは、コンセンサス配列を GENETYX で開くことができます。また、アライメント結果をテキスト表示し、保存することができます。