核酸をアミノ酸に翻訳してのホモロジー解析

ホモロジー解析プログラムは、高速・高感度な方法として多用されている Lipman-Pearson 法を採用しています。

参照配列となるアミノ酸配列データ (1st Sequence) に対して、比較対象となる核酸配列データ (2nd Sequence) をアミノ酸への翻訳 (Standard Code で相補鎖を含めた全 6 フレーム) を行い､高速に比較し、相同性 (ホモロジースコア) の高い配列データについて、配列の欠落 (GAP) を考慮したアライメント表示を行います。