遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX-MAC Ver.23 は、
多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、プラスミドマップ、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンス解析機能、配列データベース等
多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。

配列の相同性解析

• MMseqs2 の相同性検索機能 ▲
• BLAST 用データベース作成機能
• ローカルホモロジー解析
  • マルチプルアライメント風表示
• Local BLAST 検索
• NCBI BLAST 検索
• MUMmer 検索
• リファレンス配列へのマッピング機能
• アノテーション転記機能
• グローバルホモロジー解析
• マキシマムマッチング
• マルチプルアライメント
  • Muscle によるマルチプルアライメント
  • Clustal W によるマルチプルアライメント ▲
  • MAFFT によるマルチプルアライメント ▲
  • Similarity Plot
  • 分子進化系統樹
  • 系統樹 PHYLIP による解析
  • RAxML を使用した最尤法による進化系統樹 ▲
• ハープロット
• 原核生物の ORF 比較機能 ▲

核酸配列解析

• ゲノム編集機能 CRISPR / Cas9 ガイド RNA 設計支援 ▲
• 制限酵素表示形式のプリファレンス設定
• コドン最適化機能 ▲
• 原核生物の遺伝子予測機能 ▲
• 電気泳動シミュレーション機能
• 自動 Feature 認識機能
• 配列データの組成分析
• アミノ酸配列への翻訳
• 特許出願フォーム出力
• GC 含量分布図作成
• di-Nucleotide 含量分布図作成
• ダイレクトリピート、インバーテッドリピート部位の解析
• 制限酵素認識部位解析
• アミノ酸変異導入設計支援
• オープンリーディングフレームの解析
• コドンフレーム別含量分布図作成
• プロモーター部位の解析
• PCR プライマー部位の解析
• Primer 3 ▲
• tRNA 領域の解析
• ヘアピン構造部位の解析
• パリンドローム部位の解析
• RNA 二次構造予測
• siRNA ターゲット部位予測
• コドン頻度表を使ったコード領域予測
• Fickett 法を使ったコード領域予測
• CpG island 候補検索
• 5' 3' スプライス部位候補検索
• Polymerase II プロモーター部位候補検索
• PolyA signal 候補検索

アミノ酸配列解析

• 配列データの組成分析
• シグナルペプチドの予測
• 配列組換え機能
• タンパク質の等電点予測
• 核酸配列への逆翻訳
• 特許出願フォーム出力
• PEST 配列検索
• タンパク質の親水性/疎水性表示
• タンパク質の疎水性クラスター解析
• エドモンソン・ホイール・プロット法によるタンパク質の構造予測
• T 細胞抗原性部位の予測
• アミノ酸配列からの制限酵素の解析
• ペプチダーゼ処理
• タンパク質二次構造予測 (Chou-Fasman)
• Conformational Profile (Chou-Fasman)
• タンパク質の二次構造予測 (GOR)

配列データベース

• データベース構築・検索

インターネット検索支援

• Entrez 検索

PlasDraw

• プラスミド地図作図

● GENETYX-MAC (Ver.23) で機能アップされた項目

▲ 別途インストールが必要

♣ 単体ソフトウェアとしても別途販売

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上記製品の詳細につきましては HP または各製品のカタログをご参照ください

MMseqs2 の相同性検索機能

ゲノム編集機能 CRISPR/Cas9 ガイド
RNA 設計支援

コドン最適化機能

原核生物の遺伝子予測機能