■ GENETYX Ver.9 で機能アップされる項目

• ● Homology 検索機能

  ・グラフィカルに相同性部位を表示

  一目で、相同な領域を把握することができます。

  ・複数配列対複数配列の総当り検索が可能

  複数の遺伝子同士の相同性を手軽に確認できます。

  複数の検索結果をまとめて表示することができます。

  ・検索結果の履歴保存

  煩わしいファイルの保存が不要です。

  各履歴に、色やコメントをつけることができ検索結果の管理が容易です。

  ・検索結果と複数配列編集機能の連携

  検索結果から、配列を選択し、複数配列編集機能に読み込むことができます。

• ● NCBI 連携機能

  ・GENETYX のメニューから検索が可能

  ・グラフィカルに相同性部位を表示

  BLAST の結果は Homology 検索機能同様グラフィカルに表示され、履歴の管理が可能です。

• ● 配列メモ機能

  ・配列の上下にメモ及び矢印を追加

  矢印スタイルが豊富で論文に記載する図としても利用できます。

• ● 複数配列編集機能

  ・各列の保存度をグラフ表示

  配列数の多いアライメントでも一目で保存度の高い領域を確認できます。

  ・編集画面ハイライト機能

  アライメントの状況を直感的に把握できます

  ・ミスマッチハイライト

  ・一致領域を線で囲む

  ・一致、類似箇所のハイライト

  ・マルチ配列の読込みに対応

  ClustalW 等のアライメントを読み込むことができます。

• ● 系統樹表示編集機能

  ・無根系統樹表示/編集

  枝の回転や OTU 名の編集ができます。

  ・複数 OTU をアウトグループに選択可能

  OTU でソートが可能です。

  距離表が出力できます。

  ・多様な系統樹形式にて表示が可能

• ● プラスミド図の作成

  ・HTMLを使った書式設定

  文字列の一部を強調したり色付けできます。

  切断回数で、制限酵素を選択できます。

  ポリリンカーの範囲にリージョンを表示することができます。

  原点の名前と位置を変更できます。