ゲノムマッピング機能
- 配列断片の参照配列上での位置を検索
- 参照配列と断片配列を比較することで、変異解析が可能
高速制限酵素解析
- 100kbase 程度の配列であれば一瞬で解析が終了
- 即座に切断点マップと各制限酵素毎の切断点数をリスト表示
- リスト中で制限酵素を一つだけ選択すると、選択された制限酵素の認識配列、切断点情報を表示
コマンド呼び出し機能
- ユーザ独自の解析を定義
- 解析処理はオブジェクト指向スクリプト言語 Ruby で記述
遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX-MAC (Ver.16) は
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、論文作成支援、
シーケンスアセンブラー、配列データベース、ゲノムマップ等
多彩な機能、優れた操作性を持つ BIO BIG BANG を担う総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、論文作成支援、
シーケンスアセンブラー、配列データベース、ゲノムマップ等
多彩な機能、優れた操作性を持つ BIO BIG BANG を担う総合遺伝子解析ソフトウェアです。
GENETYX-MAC (Ver.16) で追加、機能アップされる項目
追加機能
機能アップ
プラスミド作図機能
- 画像ファイルの貼り付け機能
- 電気泳動ゲルの画像編集機能
系統樹
- 画像ファイルの貼り付け機能
- MEGA, PHYLIP 距離行列ファイルへの対応
配列データベース
- ディビジョン操作
- ディビジョンの作成 / 削除 / 複製
- Tag によるディビジョンの分類表示
- BLAST 用データベースの作成
- 配列操作
- 配列の登録 / 削除 / 全削除
- 配列の Export (配列毎 / 連結, オリジナル / FASTA)
- 他のディビジョンへの Export
- エントリの履歴表示
- 履歴一覧からの Revert 機能
- 履歴一覧からの Export 機能
- 検索
- キーワード検索
- Entry Name / Organism / Definition / Full Text / Accession / Keyword
- 絞り込み検索
- AND / OR / NOT
- ローカル BLAST 検索
- データベースのディビジョンに登録された配列に対しての BLAST 検索
- 結果をグラフィカルに表示
- 結果の履歴を自動的に保存して、再表示が可能
- キーワード検索
- 配列エディタとの連携
- エントリの配列エディタ / 並列エディタでの表示
- 配列エディタからディビジョンへの保存
- その他
- GENETYX Ver.10 (Windows版) のデータベースをそのまま利用可能
- GENETYX-MAC (Ver.15) の配列データベースのインポート機能
- 次世代シーケンサーの解析結果等の fna 形式のファイルのインポート機能
ゲノムマッピング機能
高速制限酵素解析
配列データベース利用例
DB 構築
公共データベース、プライベートデータベース等から任意に目的に関する遺伝情報を収集し、データベースを構築する。
取り込んだデータの分類、任意の情報入力
判定支援
サンプルの遺伝情報をデータベースと比較した結果に対し、マルチプルアライメント / 系統樹等解析処理を行い、種の判定の支援をする。
GENETYX-MAC (Ver.16) 機能
核酸・アミノ酸配列入力編集
- 配列エディタ
- 核酸配列入力編集
- 核酸配列の音声出力
- コメント入力編集
- Feature Table のツリー表示・編集
- Feature Table のマップ表示
- 複数配列編集
核酸・アミノ酸配列共通解析
- モチーフ検索
- ローカルホモロジー解析
- グローバルホモロジー解析
- マキシマムマッチング
- マルチプルアライメント
- 系統樹
- ClustalW を使ったマルチプルアライメント
- ハープロット
- ローカル BLAST 検索機能
核酸配列解析
- 各種解析の一括解析一覧表示
- 配列データ組成分析
- アミノ酸配列への翻訳
- 特許出願フォーム出力
- GC 含量分布図作成処理
- di-Nucleotide 含量分布図作成処理
- ダイレクトリピート部位の解析
- インバーテッドリピート部位の解析
- 制限酵素の解析
- 高速制限酵素解析
- アミノ酸変異導入設計支援機能
- ORF の解析
- コドンフレーム別含量分布図作成処理
- プロモーター部位の解析
- PCR プライマー部位の解析
- プライマー解析 Primer3 支援
- ハイブリダイゼーション機能
- tRNA 領域の解析
- ヘアピン構造部位の解析
- パリンドローム部位の解析
- 核酸配列二次構造予測
- siRNA ターゲット部位予測
- コドン頻度表を使ったコード領域予測
- Fickett 法を使ったコード領域予測
- CpG island の候補検索
- 5' 3' スプライス部位候補検索
- Polymerase II Promoter 部位候補検索
- PolyA signal 候補検索
アミノ酸配列解析
- 各種解析の一括解析一覧表示
- 配列データ組成分析
- シグナルペプチドの予測
- 配列組換え機能
- 蛋白質の等電点予測
- 核酸配列への逆翻訳
- 特許出願フォーム出力
- 蛋白質の親水性・疎水性表示
- 蛋白質の疎水性クラスター解析
- エドモンソン・ホイール・プロット法による蛋白質の構造予測
- T 細胞抗原性部位の予測
- アミノ酸配列からの制限酵素の解析
- ペプチダーゼ処理
- PEST 配列の検索
- 蛋白質二次構造予測 (Chou-Fasman, Robson)
- 核酸をアミノ酸に翻訳してのホモロジー解析
論文作成支援
- プラスミド作図機能
シーケンスアセンブラー
- 波形ファイルのサポート
- コンティグマップ、波形画面、アライメント画面の連動
- 解析処理
- トリミング処理
- 編集機能
配列データベース
- ディビジョンの登録 / 削除
- 配列の登録 / 削除
- キーワード検索
- 絞り込み検索
- ローカル BLAST 検索機能
- 次世代シーケンサーの解析結果等の fna 形式のファイルのインポート
ゲノムマップ
- ゲノムマッピング機能
その他
- NCBI BLAST 検索支援
- アップデート履歴チェック、アップデータの取得
- コマンド呼び出し機能
GENETYX ネットワーク版
GENETYX ネットワーク版はネットワークに接続されたパソコンの台数制限なしにインストールし、研究所（室）の全てのマシンから利用できます。
ライセンス管理が最大同時利用数（Macintosh マシン、Windows マシン混在可）になりますので効率よく安価にシステムが構築できます。
お得な教育用ライセンスもあります。
- 固定の PC に依存せずに、グループ内のどの PC からも必要な時に必要とする人が効率的に GENETYX を利用することが出来ます。
- 各人の利用状況のログを取得できますのでグループ内での利用状況を把握することが出来ます。
- 個別のバージョンアップから解放されます。また、違法コピーの撲滅対策にも有効です。
- 特定ユーザーの優先固定ライセンスが可能です。
動作環境
| 対応機種 | Mac OS X Ver.10.5 以上が動作する PowerMac, IntelMac シリーズ |
|---|---|
| 対応 OS | Mac OS X Ver.10.5 以上 (Mac OS X Ver.10.7 対応) |
| （Mac OS X Ver.10.5 未満、Mac OS 9 及び Classic 環境では使用できません） | |
| メモリ | 1GB 以上（2GB 以上を推奨） |
| HDD 容量 | 100MB 以上 |
| HFS+ でフォーマットしたもの | |
| （購入時は HFS+ でフォーマットしてあります。その他のフォーマット上では動作しません） |
多年にわたる充実したサポート
| Web サービス | GENETYX ホームページ http://www.genetyx.co.jp/ |
|---|---|
| 弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可 | |
| メールサービス | メールでのお問い合わせに対する回答 |
| 電話・FAX サービス | 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答 |
| DM サービス | 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供 |
| 有償年間保守サポート | ネットワーク版は常に最新のバージョン利用可 |
お得な特典
GENETYX® は株式会社ゼネティックスの登録商標です。
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