遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX Ver.17 は、
多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、プラスミドマップ、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンス解析機能、配列データベース等
多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。

配列の相同性解析

• BLAST 用データベース作成機能
• リファレンス配列へのマッピング機能
• ホモロジー解析
  • 検索結果をマルチプルアライメント風に表示
• Local BLAST 検索
• NCBI BLAST 検索
• cRNA プローブ検索
• PCR Primer 検索
• MUMmer 検索
• SNPs 検索
• アノテーション転記機能
• グローバルホモロジー
• マキシマムマッチング
• マルチプルアライメント
  • Muscle によるマルチプルアライメント
  • Clustal W によるマルチプルアライメント ▲
  • MAFFT によるマルチプルアライメント ▲
  • Similarity Plot
  • 分子進化系統樹
    • ブートストラップ値の % 表示切替
• ハープロット
• 原核生物の ORF 比較機能 ▲

核酸配列解析

• ゲノム編集機能 CRISPR / Cas9 ガイド RNA 設計支援 ▲
• 電気泳動シミュレーション機能
• 配列データの組成分析
• アミノ酸配列への翻訳
• 特許出願フォーム出力
• GC 含量分布図作成
• di-Nucleotide 含量分布図作成
• ダイレクトリピート、インバーテッドリピート部位の解析
• 制限酵素認識部位解析
• サイレント変異導入設計支援
• オープンリーディングフレームの解析
• コドンフレーム別含量分布図作成
• プロモーター部位の解析
• PCR プライマー部位の解析
• Primer 3 ▲
• ハイブリダイゼーション機能
• tRNA 領域の解析
• ヘアピン構造部位の解析
• パリンドローム部位の解析
• RNA 二次構造予測
• siRNA ターゲット部位予測
• エクソン部位検索
• コドン頻度表を使ったコード領域予測
• Fickett 法を使ったコード領域予測
• CpG island 候補検索
• 5' 3' スプライス部位候補検索
• Polymerase II プロモーター部位候補検索
• Gibson Assembly
• コドン最適化 ▲
• 制限酵素によるクローニング機能

アミノ酸配列解析

• 配列データの組成分析
• シグナルペプチドの予測
• 配列組換え機能
• タンパク質の等電点予測
• 核酸配列への逆翻訳
• 特許出願フォーム出力
• PEST 配列検索
• タンパク質の親水性/疎水性表示
• タンパク質の疎水性クラスター解析
• エドモンソン・ホイール・プロット法によるタンパク質の構造予測
• タンパク質のヘリックス構造展開表示
• T 細胞抗原性部位の予測
• アミノ酸配列からの制限酵素の解析
• ペプチダーゼ処理
• タンパク質二次構造予測 (Chou-Fasman)
• Conformational Profile (Chou-Fasman)
• タンパク質の二次構造予測 (GOR)

配列データベース

• データベース構築・検索
  • MySQL サーバーを使用してデータベースの共有
  • 配列の構築履歴の記録

インターネット検索支援

• Entrez 検索

PlasDraw

• プラスミド地図作成

● GENETYX Ver.17 で機能アップされた項目

▲ 別途インストールが必要

♣ 単体ソフトウェアとしても別途販売

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GENETYX ネットワーク版

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上記製品の詳細につきましては HP または各製品のカタログをご参照ください

BLAST 用データベース作成

リファレンス配列へのマッピング機能

ゲノム編集機能 CRISPR/Cas9 ガイド RNA 設計支援

電気泳動シミュレーション機能