遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX Ver.14 は、
多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、
プラスミドマップ、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンサー対応機能、配列データベース、
ゲノムマップ等多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。
GENETYX Ver.14 の機能
●印は GENETYX Ver.14 で機能アップされた項目です。
核酸・アミノ酸配列入力編集
配列の相同性解析
- ●ホモロジー解析
- ●Local BLAST 検索
- ●NCBI BLAST 検索
- cRNA プローブ検索
- PCR Primer 検索
- MUMmer
- SNPs 検索
- ●アノテーション転記機能♦
- グローバルホモロジー
- マキシマムマッチング
- ●マルチプルアライメント
- ハープロット
核酸配列解析
- 配列データの組成分析
- アミノ酸配列への翻訳
- 特許出願フォーム出力
- GC 含量分布図作成
- di-Nucleotide 含量分布図作成
- ダイレクトリピート、インバーテッドリピート部位の解析
- 制限酵素認識部位解析
- サイレント変異導入設計支援
- オープンリーディングフレームの解析
- コドンフレーム別含量分布図作成
- プロモーター部位の解析
- PCR プライマー部位の解析
- Primer 3
- ハイブリダイゼーション機能
- tRNA 領域の解析
- ヘアピン構造部位の解析
- パリンドローム部位の解析
- RNA 二次構造予測
- siRNA ターゲット部位予測
- エクソン部位検索
- コドン頻度表を使ったコード領域予測
- Fickett 法を使ったコード領域予測
- CpG island 候補検索
- 5' 3' スプライス部位候補検索
- Polymerase II プロモーター部位候補検索
- PolyA signal 候補検索
- ●ゲノム編集機能 CRISPR / Cas9 ガイド RNA 設計支援★
アミノ酸配列解析
- 配列データの組成分析
- シグナルペプチドの予測
- 配列組換え機能
- タンパク質の等電点予測
- 核酸配列への逆翻訳
- 特許出願フォーム出力
- PEST 配列検索
- タンパク質の親水性/疎水性表示
- タンパク質の疎水性クラスター解析
- エドモンソン・ホイール・プロット法によるタンパク質の構造予測
- タンパク質のヘリックス構造展開表示
- T 細胞抗原性部位の予測
- アミノ酸配列からの制限酵素の解析
- ペプチダーゼ処理
- タンパク質二次構造予測 (Chou-Fasman)
- Conformational Profile (Chou-Fasman)
- タンパク質の二次構造予測 (GOR)
配列データベース
インターネット検索支援
プラスミドマップ (PlasDraw)
シーケンスアセンブラー (ATGC) ♣
次世代シーケンサー対応機能
(GENETYX-Genome) ♣
- ●クオリティチェック機能
- ●トリミング機能
- ●配列組成表示機能
- ●配列全体 MAP 表示機能
- ●発現量解析機能 (カウントのみ)★
- ●De Novo Assembly MIRA★
- ●解析履歴機能
- 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
- マッピング機能
- BAM/SAM 形式データ読み込み機能
- ペアエンドマッピング
- 複数の染色体別に同時マッピング
- 参照配列の Feature の表示
- 変異表の CSV 出力、印刷
- De Novo Assembly Forge (64bit OS / 8GB メモリ以上での利用を推奨)
ゲノムマップ (G-MAP) ♣
★64bit OS のみ対応 ♦64bit OS 推奨 ♣単体ソフトウェアとして別途販売。
▲Clustal W, MAFFT, RAxML, 発現量解析, MIRA は別途インストールが必要です。ゲノムデータは別途ダウンロードが必要です。
プロジェクトウィンドウ
パラレルエディタ
分子進化系統樹
シーケンスアセンブラー
GENETYX Ver.14 で追加、改良された機能
次世代シーケンサー対応機能 (GENETYX-Genome)
- クオリティチェック機能の追加
- トリミング機能の追加
- 配列全体 MAP 表示機能の追加
- 配列組成表示機能の追加
- 解析履歴機能の追加
- 発現量解析機能の追加 (カウントのみ)★
- De Novo Assembly MIRA の追加★
ホモロジー解析
- NCBI BLAST の改良
- 10本まで並列検索が可能になりました。
- Discontiguous megablast 検索と Quick Blastp 検索を追加しました。
- ゲノム編集機能の追加★
- CRISPR / Cas9 ガイド RNA 設計支援機能を追加しました。
- ゲノムに対する特異性の確認機能を追加しました。 (完全一致のみ)
- 特異性の確認はヒトゲノム (GRCh38) に対して Core i5 3.10GHz SSD 200GB メモリ 8GB の PC で 5 分程度の時間がかかります。
- ホモロジー検索の改良
- 検索結果をマルチプルアライメント風に表示が可能になりました。
- Local BLAST の改良
- Local BLAST のダイアログから直接ディビジョンに登録が可能になりました。
- アノテーション転記機能の追加♦
- ゲノムのアノテーション情報をコンティグ配列に転記が可能になりました。
プロジェクトウィンドウ (配列エディタ)
- 波形ファイルの読み込み機能の追加 (配列のみ)
- 拡張子が ab1, scf のファイルの読み込みが可能になりました。
マルチプルアライメント
- 解析履歴機能の追加
- マルチプルアライメントの解析結果と解析条件の保存・表示が可能になりました。
- マルチプルアライメント機能の追加
- MAFFT を使ったマルチプルアライメントが可能になりました。
- 系統樹 最尤法の追加★
- RAxML を使用した最尤法による系統樹を構築が可能になりました。
DEMO 版取得先
★64bit OS のみ対応 ♦64bit OS 推奨
▲発現量解析, MIRA, MAFFT, RAxML は別途インストールが必要です。ゲノムデータは別途ダウンロードが必要です。
次世代シーケンサー対応機能
ホモロジー検索
系統樹 最尤法
動作環境
| 対応機種 | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7 が動作する機種 |
|---|---|
| OS | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7 ※以上全て日本語版、32bit OS / 64bit OS |
| メモリ | 2GB 以上 (推奨 4GB 以上) |
| HDD 容量 | 1GB 以上の空き容量 |
| その他 | Internet Explorer Ver.11 以上がインストールされていること |
| 本製品のご使用にはインターネットによるライセンス認証が必要 |
多年にわたる充実したサポート
| Web サービス | GENETYXホームページ http://www.genetyx.co.jp/ |
|---|---|
| 弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、DEMO版、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可 | |
| メールサービス | メールでのお問い合わせに対する回答 |
| 電話・FAX サービス | 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答 |
| DM サービス | 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供 |
| 年間利用料 | 年間の利用料金はかかりません |
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